R 語言與 Bioconductor 生物信息學應用 R语言与Bioconductor生物信息学应用

高山、歐劍虹、肖凱

  • 出版商: 天津科譯
  • 出版日期: 2014-01-01
  • 定價: $348
  • 售價: 8.5$296
  • 語言: 簡體中文
  • 頁數: 224
  • 裝訂: 平裝
  • ISBN: 7543333600
  • ISBN-13: 9787543333604
  • 相關分類: R 語言

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商品描述

<內容簡介>

高山編著的《R語言與Bioconductor生物信息學應用》從實際課題出發,提出解決問題的思路,結合原理或基礎知識,但更偏重解決問題的框架和流程,選用簡單易學但功能強大的R語言,把講解延伸到具體程序代碼,讓讀者100%經歷整個課題研究過程。
    《R語言與Bioconductor生物信息學應用》由多名R領域專家(均為一線科研工作者)通過因特網聯手寫作。通過前期網上調研,瞭解並在書中突出大多數人普遍關心而又難尋相關資料的問題。
    所見即所得,學到的知識可以通過簡單編程(僅僅代碼拷貝粘貼)加以實現,印象深刻,學了不易忘。提出三板斧學習法,讓無基礎的人也能編程。
    作者通過QQ群直接面向讀者答疑,並提供大量參考資料和習題答案。使用正版書籍的讀者(實名制)均可入群享受最好的服務。
    《R語言與Bioconductor生物信息學應用》既不羅列基礎知識湊字數,也不使用光盤,減輕讀者負擔又保護環境。

<目錄>

第一章 R基礎知識
  1.1 什麼是R
  1.2 R的下載與安裝
  1.3 R語言快速入門
  1.4 一些簡單的語法知識
  1.5 本章源代碼詳解及小結
第二章 生物信息學基礎知識
  2.1 中心法則——生物信息流
  2.2 測序與序列分析
  2.3 基因表達分析
  2.4 註釋、統計與可視化
第三章 R在生物信息學中的簡單應用
  3.1 一個序列分析課題
  3.2 用R包(非Bioconductor)實現課題
  3.3 用R包(Bioconductor)再實現課題(方法一)
  3.4 用R包(Bioconductor)再實現課題(方法二)
第四章 Bioconductor簡介
  4.1 什麼是Bioconductor
  4.2 Bioconductor的分類介紹
  4.3 從R到Bioconductor的跨越
第五章 Bioconductor分析基因芯片數據
  5.1 快速入門
  5.2 基因芯片基礎知識
  5.3 基因芯片數據預處理
  5.4 基因芯片數據分析
  5.5 芯片處理實際課題一
  5.6 芯片處理實際課題二
  5.7 芯片處理實際課題三
第六章 Bioconductor分析RNA-seq數據
  6.1 示例課題介紹
  6.2 高通量測序基礎知識
  6.3 RNA-seq技術的特點
  6.4 RNA-seq數據預處理
  6.5 RNA-seq數據分析
第七章 R的高級語法與如何創建R包
  7.1 R的高級語法
  7.2 創建及發布自己的R/Bioconductor包
  7.3 R包結構
附錄A 進一步學習的資源
附錄B R常用函數
附錄C R的內存管理和幫助系統