Evolutionary Computation in Bioinformatics (Hardcover)

Gary B. Fogel, David W. Corne

  • 出版商: Morgan Kaufmann
  • 出版日期: 2002-09-16
  • 售價: $3,770
  • 貴賓價: 9.5$3,582
  • 語言: 英文
  • 頁數: 393
  • 裝訂: Hardcover
  • ISBN: 1558607978
  • ISBN-13: 9781558607972
  • 相關分類: 生物資訊 Bioinformatics
  • 立即出貨 (庫存=1)

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商品描述

This book offers a definitive resource that bridges two communities. Gary Fogel and David Corne, well-known representatives of these fields, have written an introduction to biology and bioinformatics for computer scientists and an introduction to evolutionary computation for biologists and for computer scientists unfamiliar with these techniques. The remaining eighteen chapters, written by leading computer scientists and biologists examine successful applications of evolutionary computation in areas such as: DNA sequencing, protein folding, DNA annotation, gene and protein classification, drug targeting, drug design, data mining of biological databases, and biodata visualisation. The appendix provides a full listing of biological data resources.

Contents


PART I - Introduction to the Concepts of Bioinformatics and Evolutionary Computation  
 
Chapter 1. An Introduction to Bioinformatics for Computer Scientists  
Chapter 2. An Introduction to Evolutionary Computation for Biologists  
 
PART II - Sequence and Structure Alignment  
Chapter 3. Determining Genome Sequences from Experimental Data Using Evolutionary Computation  
Chapter 4. Protein Structure Alignment Using Evolutionary Computation  
Chapter 5. Using Genetic Algorithms for Pairwise and Multiple Sequence Alignments  
 
PART III - Protein Folding  
Chapter 6. On the Evolutionary Search for Solutions to the Protein Folding Problem  
Chapter 7. Toward Effective Polypeptide Structure Prediction with Parallel Fast Messy Genetic Algorithms  
Chapter 8. Application of Evolutionary Computation to Protein Folding with Specialized Operators  

 
PART IV - Machine Learning and Inference  
Chapter 9. Identification of Coding Regions in DNA Sequences Using Evolved Neural Networks  
Chapter 10. Clustering Microarray Data with Evolutionary Algorithms  
Chapter 11. Evolutionary Computation and Fractal Visualization of Sequence Data  
Chapter 12. Identifying Metabolic Pathways and Gene Regulation Networks with Evolutionary Algorithms  
Chapter 13. Evolutionary Computational Support for the Characterization of Biological Systems  

PART V - Feature Selection  
Chapter 14. Discovery of Genetic and Environmental Interactions in Disease Data Using Evolutionary Computation  
Chapter 15. Feature Selection Methods Based on Genetic Algorithms for in Silico Drug Design  
Chapter 16. Interpreting Analytical Spectra with Evolutionary Computation  
Appendix: Internet Resources for Bioinformatics Data and Tools

商品描述(中文翻譯)

本書提供了一個連接兩個領域的權威資源。Gary Fogel和David Corne是這兩個領域的知名代表,他們為計算機科學家撰寫了一本介紹生物學和生物信息學的書籍,並為生物學家和對這些技術不熟悉的計算機科學家撰寫了一本介紹進化計算的書籍。其餘的十八章由領先的計算機科學家和生物學家撰寫,探討了進化計算在DNA序列、蛋白質折疊、DNA註釋、基因和蛋白質分類、藥物靶向、藥物設計、生物數據庫的數據挖掘和生物數據可視化等領域的成功應用。附錄提供了生物數據資源的完整列表。

目錄:

第一部分 - 生物信息學和進化計算概念介紹
第1章:針對計算機科學家的生物信息學介紹
第2章:針對生物學家的進化計算介紹

第二部分 - 序列和結構對齊
第3章:使用進化計算從實驗數據中確定基因組序列
第4章:使用進化計算進行蛋白質結構對齊
第5章:使用遺傳算法進行兩兩和多序列對齊

第三部分 - 蛋白質折疊
第6章:尋找蛋白質折疊問題解決方案的進化搜索
第7章:使用並行快速混亂遺傳算法進行有效的多肽結構預測
第8章:應用進化計算進行具有專門運算子的蛋白質折疊

第四部分 - 機器學習和推理
第9章:使用進化神經網絡識別DNA序列中的編碼區域
第10章:使用進化算法對微陣列數據進行聚類
第11章:進化計算和序列數據的分形可視化
第12章:使用進化算法識別代謝途徑和基因調控網絡
第13章:進化計算支持生物系統特性的表徵

第五部分 - 特徵選擇
第14章:使用進化計算在疾病數據中發現基因和環境相互作用