病原微生物資源系統保藏學
魏強 主編
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目錄大綱
目 錄
第一篇 基礎與理論
第一章 緒論 3
第一節 生物資源概述 3
第二節 微生物資源概述 8
第三節 國際病原微生物資源利用進展 14
第二章 生物資源管理 23
第一節 生物安全 23
第二節 科技倫理 31
第三節 微生物保藏機構歷史與現狀 35
第四節 科學研究中病原微生物菌（毒）種規範使用 54
第三章 生物資源保護 63
第一節 生物資源保護重要性 63
第二節 生物資源保護概況 65
第三節 國際生物資源保護規則 70
第四節 生物資源知識產權保護 76
第二篇 方法與實踐
第四章 病原微生物資源獲取 85
第一節 樣本采集 85
第二節 樣本包裝與運輸 91
第三節 樣本接收和處理 96
第四節 消毒技術 101
第五章 細菌保藏鑒定技術 107
第一節 分離和培養 107
第二節 形態學檢查 111
第三節 血清學 114
第四節 生化鑒定 117
第五節 免疫學檢測 124
第六節 分子生物學 128
第七節 基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜法 131
第八節 分子分型方法和溯源 139
第九節 新種鑒定方法 144
第十節 活性評價方法 148
第六章 病毒保藏鑒定技術 152
第一節 分離和培養 152
第二節 形態學鑒定 158
第三節 血清學檢測鑒定 173
第四節 免疫學實驗 179
第五節 分子生物學檢測 192
第六節 新型病毒鑒定 215
第七節 活性評價方法 221
第七章 真菌保藏鑒定技術 233
第一節 分離培養和形態學鑒定 233
第二節 分子生物學鑒定 237
第三節 基於MALDI-TOF MS鑒定 245
第八章 噬菌體保藏鑒定技術 250
第一節 噬菌體分類 250
第二節 噬菌體增殖 255
第三節 噬菌體純化 259
第四節 噬菌體滴度測定 264
第九章 寄生蟲保藏鑒定技術 269
第一節 采集和培養 269
第二節 形態學鑒定 273
第三節 免疫學檢測 279
第四節 分子生物學檢測 284
第五節 活性評價方法 287
第十章 病原微生物低溫保存技術 294
第一節 低溫保存基本理論 294
第二節 常用低溫保護劑 301
第三節 低溫保藏方法 308
第四節 細菌保存方法 315
第五節 病毒保存方法 322
第六節 真菌保存方法 326
第七節 噬菌體保存方法 330
第十一章 實驗動物操作技術 340
第一節 常規操作技術 340
第二節 小鼠操作技術 353
第三節 大鼠操作技術 357
第四節 豚鼠操作技術 359
第五節 兔操作技術 361
第六節 實驗猴操作技術 363
第十二章 生物信息學技術 367
第一節 概述 367
第二節 生物信息學工具 369
第三節 生物信息學數據庫和在線資源 374
第十三章 資源編目 382
第一節 資源編號 382
第二節 資源目錄 387
第三節 標簽技術 390
第四節 信息管理系統與資源共享平臺 394
第十四章 資源數字化與數據平臺建設 405
第一節 資源數字化 405
第二節 文件信息管理概述 408
第三節 生物數據信息管理 411
第四節 數據電子化及資源管理 413
第五節 組學數據管理和分析 416
第六節 數據共享、數據安全和隱私計算 418
第七節 重要病原微生物數據平臺及應用 421
第十五章 病原微生物資源質量管理 429
第一節 概述 429
第二節 管理要求 431
第三節 技術方法 436
第四節 特殊要求 440
第三篇 建設與運行
第十六章 生物樣本庫概述 445
第一節 生物樣本庫概況 445
第二節 生物樣本庫現狀 449
第三節 生物樣本庫發展趨勢 455
第四節 AI與生物樣本庫 457
第五節 傳染性疾病樣本資源庫 460
第十七章 生物樣本庫儀器與設備 466
第一節 前處理設備 466
第二節 標簽標識與標簽識別設備 476
第三節 凍存管、凍存盒、凍存架及配套操作設備 479
第四節 冰箱類存儲設備 485
第五節 液氮類存儲設備 489
第六節 液氮塔 493
第七節 自動化樣本存儲設備 498
第八節 安全監測預警系統 505
第九節 高壓蒸汽滅菌器 509
第十節 個人防護裝備 513
第十一節 冷凍幹燥設備 518
第十八章 生物樣本庫質量和能力要求 526
第一節 人類遺傳資源保藏通用要求 526
第二節 組織管理 531
第三節 場所、設施與設備管理 532
第四節 過程管理 534
第五節 質量管理體系 542
第六節 樣本保藏質量管理 545
第七節 實驗室生物安全管理體系 548
第十九章 智能化和信息化技術 558
第一節 概述 558
第二節 二維碼技術流程管理 561
第三節 基於RFID技術的物聯網流程管理 571
第四節 定位管理 580
第五節 病原微生物菌（毒）種信息管理平臺應用實例 586
第二十章 自動化保藏 599
第一節 自動化保藏系統原理 599
第二節 自動化保藏系統軟件架構 603
第三節 自動化保藏系統硬件結構 607
第四節 自動化保藏需求設計 612
第五節 自動化保藏系統建設準備 616
第六節 自動化保藏系統功能與使用流程 619
第七節 自動化保藏日常維護及應急處置 624
第二十一章 生物樣本庫認可 628
第一節 生物樣本庫認可及標準化 628
第二節 生物樣本庫認可要求 631
第三節 生物樣本庫認可過程 634
第二十二章 病原微生物保藏機構建設與管理 639
第一節 規劃布局 639
第二節 建築、裝飾裝修和結構設計要求 642
第三節 通風空調系統 645
第四節 給排水和供氣 653
第五節 電氣自控 655
第六節 消防 660
第七節 案例 661
第二十三章 病原微生物保藏機構指定 673
第一節 保藏機構指定及標準化 673
第二節 保藏機構指定要求與指定程序 677
第三節 保藏機構指定工作進展 685
第二十四章 生物安保 688
第一節 安全管理制度 688
第二節 人員安全 691
第三節 菌（毒）種安全 694
第四節 信息安全 697
第五節 反恐怖防範 702
第四篇 共享與應用
第二十五章 資源挖掘 709
第一節 資源挖掘概述 709
第二節 樣本宏基因組庫 714
第三節 基因組庫 718
第四節 蛋白組庫 721
第五節 代謝組庫 725
第六節 免疫組/抗體庫 729
第七節 耐藥組庫 734
第八節 轉錄組庫 739
第二十六章 資源標準化 745
第一節 資源標準體系概述 745
第二節 數據資源標準 753
第三節 實物資源標準 754
第四節 國家標準株體系 756
第二十七章 資源共享 764
第一節 共享機制 764
第二節 接收保藏與對外提供協議 771
第三節 數據資源共享 775
第四節 實物資源共享 779
第二十八章 資源轉化與應用 785
第一節 傳染病監測與溯源 785
第二節 體外診斷應用 789
第三節 臨床檢驗應用 802
第四節 藥物篩選應用 808
第五節 疫苗研發應用 815
第六節 消毒領域應用 822
第七節 食品領域應用 825
第八節 健康與環境領域應用 835
第九節 醫學實驗教學應用 840
第十節 出入境和國境檢疫應用 844
第十一節 生物計量應用 847
第十二節 儀器設備研發應用 851
第十三節 噬菌體應用 854
第十四節 傳染性疾病動物模型應用 861
第十五節 基因編輯技術應用 868
