生物人的電腦教室(生物資訊入門者的必備讀物,非資訊專業者也能快速上手!)

李鎮宇(Eric Lee)

  • 出版商: 碁峰
  • 出版日期: 2016-03-14
  • 定價: $380
  • 售價: 8.5$323
  • 貴賓價: 8.0$304
  • 語言: 繁體中文
  • 頁數: 264
  • ISBN: 9863479500
  • ISBN-13: 9789863479505
  • 相關分類: Bioinformatics 生物資訊

立即出貨 (庫存 < 8)

買這商品的人也買了...

相關主題

商品描述

 

<內容簡介>

生物資訊入門者的必備讀物,非資訊專業者也能快速上手!

生物資訊學(Bioinformatics),主要的精神就是利用個人電腦的計算能力,在原始的生物資料被數位化之後,用資訊科學的方法嘗試解決問題。把過去需要用人工處理的資料,交給電腦自動化處理,產出一個結果交給研究人員進行判讀,解釋出其中的生物意義。這個學門整合了應用數學、資訊科學、統計學去研究生物學,研究的領域也相當廣泛,例如蛋白質結構預測、序列比對、序列重組、基因表現與遺傳演化等等。

本書的目的,就是為了幫助本身非資訊專業的研究者,學會基本的軟體操作能力,善用電腦這項工具,培養足以因應研究所需的「資訊技能」。

透過本書,您可以:
.學會基礎Linux指令,了解重要操作指令。
.學會高通量定序基礎操作,實戰生物資訊入門。
.藉由GPU輔助運算實際展示,感受繪圖卡潛在威力。
.透過研究流程腳本設計,實現計算全自動。
.藉由計算平台設定指南,部署圖形化雲端服務。

 

<章節目錄>

第一章:準備工作
1.1 從採購新電腦談起
1.2 運算伺服器的設定
1.3 建立遠端連線

第二章:基本Linux指令介紹
2.1 沒有要你當Linux專家
2.2 資料夾的操作
2.3 檔案的操作
2.4 權限的指派分配
2.5 了解系統狀態的相關指令
2.6 其他實用指令介紹

第三章:序列品質檢查
3.1 淺談高通量定序
3.2 高通量定序的先天問題
3.3 關於品質分數的標準
3.4 實戰品質校驗

第四章:序列比對
4.1 序列比對的意義
4.2 選擇序列比對工具
4.3 序列比對的實際操作
4.4 序列比對結果轉檔
4.5 使用基因體瀏覽器

第五章:繪圖卡輔助運算
5.1 繪圖卡的計算優勢
5.2 繪圖卡運算的業界標準與使用
5.3 生物資訊的實際應用
5.4 成效有限的理由

第六章:研究流程建立
6.1 實現計算全自動
6.2 編寫腳本語言
6.3 測試與除錯
6.4 實作案例分享
6.5 常見失敗案例分析

第七章:雲端圖型化
7.1 淺談雲端架構
7.2 Amazon雲端平台
7.3 開放式生物計算雲端平台
7.4 安裝與設定自己的Galaxy伺服器

附錄A:研究生入門:準備期刊文獻報告
附錄B:生物資訊研究相關文獻檢索
附錄C:簡單的資料處理實務

 

<作者介紹>

李鎮宇(Eric Lee)
一個在求學階段從第一類組到三類組都經歷過的資訊工作者。熱愛寫作閱讀、旅遊還有最新科技。喜歡用文字分享心得,讓知識與經驗得以傳承。寫作題材涉及科技、旅遊、生命科學、社會觀察等領域,常讓人摸不透他的特長為何。用心生活,期許自身的專業可以幫助他人。現旅居海外,為資訊相關領域從業人員。